Диапсиды (Diapsida) были следующей группой, которая отделилась от котилозавров. Отличительной чертой черепов этих животных были две височные впадины, которые располагались ниже и выше заглазничной кости. В конце палеозойской эры диапсиды развили большое количество групп и видов, которые стали прародителями , как многих доисторических ящеров, так и современных рептилий. Диапсиды развились в две основных подгруппы
Лепидозавроморфы (Lepidosauromorpha) и Архозавроморфы (Archosauromorpha).
Отряд Эозухии были наиболее примитивными диапсидами из группы Лепидозавров , они стали прародителями Клювоголовых, которых в наши дни представляют гаттерии.
К концу пермского периода от примитивных диапсидов отделились так называемые чешуйчатые (Squamata) , которые стали очень многочисленным видом в меловом периоде. От них же произошли змеи.
Всех современных пресмыкающихся относят Учёные к группе диапсидов, кроме черепах. Предки крокодилов, ящериц, змей и гаттерии известны уже с раннего мезозоя. Динозавров так же относят к вымершим 65 млн. лет назад динозаврам и птерозаврам , а так же к целому ряду мало известных форм, которые начали появляться в конце карбона.
Самый древний из известных диапсидов назван Петролакозавр (Petrolacosaurus) , который проживал в Канзасе , Пенсильвания. Многими чертами скелета животное напоминает проторотирид Hylonomus и Paleothyris. Их тела немного крупнее , длинной эти животные вырастали до 30 см. Конечности были длиннее и рептилия выглядела более пропорциональна . По мелкому черепу Петролакозавр очень напоминает более ранних проторотирид. Челюстная система состоит из многочисленных мелких зубов по краям , среди которых есть пара клыков . Зубы сидят не глубоко в челюстях . Вероятно ранние диапсиды питались в основном насекомыми , как самые примитивные амниоты, но обладали стратегиями охоты и на более крупных существ.